La première gare du terminus de Croix-de-Vie est ouverte le 17 octobre 1881. Elle est bâtie à l'emplacement d'une vasière du premier bassin de l'actuel port de pêche, notamment pour acheminer les cargaisons de poissons vers Nantes. Actuellement, la gare de Saint-Gilles-Croix-de-Vie est uniquement desservie par des trains TER Pays de la Loire en provenance de Nantes. La ligne qui longe le port avec ses deux voies en est une étonnante spécificité.
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